本研究提出了一种利用原子基础模型（AFMs）嵌入表示局部蛋白质环境的新方法，该方法能高保真地捕捉蛋白质的结构和化学细节，并在准确性和泛化性上超越传统描述符。这些嵌入被成功应用于核磁共振（NMR）光谱的化学位移预测，实现了最先进的精度，并首次提供了基于数据驱动似然的置信度估计。此外，该方法还支持蛋白质结构的局部重建和精细结构质量评估。发表于 2025年06月11日。

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